hop

Klasik tanı prosedürleri için potansiyel patojenin kültürde üretilmesi için yavaş ve pahalı ne gereklidir?

DOĞRU MU ? KLAMİDYA ENFEKSİYONLARINA uygun tedavi prosedürleri uygulanamaz.

HEDEF BİR PROTEİN İSE Tanıda antikorların kullanılabilmesi için hedef genlerin …… ve … gereklidir.

Niçin ANTİKORLAR tanıda çok uygun kullanılabilir araçlardır?

klamidya enfeksiyonları için hangisi doğru

SPESİFİTE

DUYARLILIK (SENSİTİVİTE)

Basitlik

ELİSA

Doğal olarak floresan üreten veya ışık yayan proteinler....................... olarak kullanılırlar. ............... protein genleri hücrelerin çevredeki fiziksel veya kimyasal bileşene ölçülebilir bir yanıt vermeleri için kullanılabilir.

Renkli Floresan Proteinler

......................., enzimlerle oluşan kimyasal tepkime ile ısı yerine çıkan soğuk ışık tır.

………. kimyasal tepkime sonucu oluşan IŞILDAMANIN canlıların oluşturduğu çeşididir.

Işık yayan reaksiyonu katalizler. bakteriler, algler, funguslar,

Bakteri LUSİFERAZ Genleri

OPTİK GÖRÜNTÜLEME yöntemlerinde canlı organizmada ışık üretimi hangileriyle gerçekleşir?
I BİYOLÜMİNESANS
IIFLORESANS
III CERENKOV LÜMİNESANS

Diğer canlıların LUSİFERAZ Genleri

Bakteriyal LUX Genleri

IŞIK SİNYALI=

Floresan görüntüleme proses aşamaları?

In vivo Görüntüleme nedir?

IN VİVO GÖRÜNTÜLEMME KAÇA AYRILIR?

IN VİVO GÖRÜNTÜLEMENİN AVANTAJLARI

Moleküler süreçleri ölçmenin diğer yöntemleriyle karşılaştırıldığında, in vivo görüntülemenin avantajı vardır:

NÜKLEİK ASİT HİBRİDİZASYONU HANGİ TESTLERİN TEMELİNİ OLUŞTURUR?

NÜKLEİK ASİT HİBRİDİZASYONU Tanı testi elemanları

NÜKLEİK ASİT HİBRİDİZASYONU şema

NÜKLEİK ASİT HİBRİDİZADYONU yapılan bir örnekte hedef miktarı az ise önce … ile çoğaltma yapılabilir.

Nükleik asit hibridizasyonunda ………olup olmadığını araştırmak için farklı organizmalarla hibridizasyon denemeleri yapılmalıdır.

Plasmodium falciparum’ un tanısında kullanılan DNA probu

Radyoaktif Olmayan Hibridizasyon Prosedürleri nasıl gerçekleştirilir?

en yaygın kullanılan prob işaretleme yöntemlerinden birisi?

DNA prob hibridizasyon işlemi;

özel bir biyolojik karakterin tanımlanması için nükleotid sekansları kullanılması .................. dur.

nükelik asit hibiridizasyon şemasında neler vardır?

hibridizsyon probları hangisi olamaz?

plasmodium falciparum tanısında kullanılan DNA probu hangi hastalığın tanısında kullanılır?

sitma enfeksiyonu tayini nasıl yapılmaktadır

....................... sistemler sinyal amplifikasyonu, kromogenik ( substartaın enzim ile reak. sonucu renk oluşturması) veya kemilüminesan substratların enzimatik dönüşümüyle gerçekleştirilir.

radyoaktif olmayan sistemlerin avantajları nelerdir.

moleküler beacons nedir

Bireylerin DNA analiziyle ayırt edilmesine ................................ denir.

9-40 bp boyutunda tekaralardan oluşan hrhangi bir protein kodlamayan ve farklı kişilerde farklı uzunluklarda olan DNA dizilerine ............................. denir

........................... adli tıp olaylarında ve özellikle bitki kültür varyetelerinin tiplendirilmesinde kullanılan, palindromik sekanslar içermeyen tesadüfi primerler kullanılarak hedef bitki DNA’sında amplifikasyon yapılan bir yöntemidir .

RAPD yönteminin avantajları

DNA’nın floresan bir boyayla işaretlenmesi ve çift iplikli DNA’ya boyanın bağlanması sonucu oluşan floresanın izlenmesi ile PCR ürünlerinin üretiminin izlenmesi ............................ yöntemi ile yapıllır. birçok patojenin ve indikatörün saptanmasında ve izlenmesinde kullanılmaktadır.

Real Time PCR 4 fazda gerçekleşir.

gen ifadesi aranıyorsa total RNA izolasyonu yapılır. RNA, cDNA ya çevrilir. ve .................. PCR yöntemi ile çoğaltılır. prokaryotik hücrelerdeki veya farklı ökaryotik dokulardaki birçok mRNA’nın miktarlarının belirlenmesinde kullanılmaktadır.

............................ antikorların özgüllüğü ile PCR’ın duyarlılığını birleştiren bir yöntemdir. streptavidin-biotin kompleksi 2. antikora alkalen fosfataz yerine 246 bp’lik dizisi bilinen bir DNA fragmenti bağlar. ( ELİSA yönteminde bağlanan enzim yerine ( alkalan fosfataz) PCR amplifikasyonu sğalayan sinyal bağlanması ile yapılır.)

Bir bireydeki çok sayıda bulunan SNP’ lerin (tek nükleotid polimorfizmi) incelenmesi ve SNP motiflerinin populasyondaki diğer bireylerin motifleriyle karşılaştırılmasıyla .......................... yapmak mümkündür.

Bir bireyin soyunun araştırılması için 3 farklı DNA kullanılabilir;

.................................... birçok nesil boyunca çok az değiştiklerinden, karakterizasyonu insanlığın genetik tarihçesinin yüzlerce nesil boyunca izlenmesi için ideal bir yoldur.

hayvamn türlerinin belirlenmesinde hangi yöntem kullanılır?

Otomatize DNA Analizi

Patojenik bir durumu baskılayabilen bir ............................... nın etkili bir terapötik ajan olabilmesi için hedefe spesifik olarak bağlanması ve proteinin translasyonunu engellemesi gereklidir.

Kimyasal olarak sentezlenen antisens oligonükleotidlerin etkinlikleri nelere bağlıdır?

üç çeşit antisense mekanizması vardır:

Translasyon sırasında floresan boyalarla işaretlenen hücresel proteinlerin proteomik analizi ile antisens oligonun spesifik bir proteinin üretimini azaltıp azaltmadığının saptanması .................. ile belirlenebilir.

Oligodeoksinükleotidler hücre içi endonükleazlara duyarlı olduklarından hedefle hibridizasyon özellikleri etkilenmeden dirençli hale getirilmeleri gereklidir. bunun için fosfodiester bağında serbest O2 yerine bir kükürt grubu içeren oligonükleotidler kullanılır. bu modifikasyona ........................... denir. (RNAdegredasyonu)

phosphorothioate oligonükleotitleri özellikleri (RNAdegredasyonu)

RNA- DNA hibritlerini tanıyan, kesen, birbirinden ayıran oligonükleotitler ...........................dir. (RNAdegredasyonu)

birinci generasyon terapötik ajanlar olarak isimlendirilirler. (RNAdegredasyonu)

FDA tarafından AIDS hastalarında retinadaki CMV enfeksiyonunun tedavisi için bir ....................... nun kullanımı kabul edilmiştir. Bu spesifik oligoya ............................. adı verilmiş olup ......................... ismiyle satılmaktadır. (RNAdegredasyonu)

“İkinci generasyon” antisens oligolarda tipik olarak ribozun 2’ pozisyonunda ....................... modifikasyonları bulunur. Bunlar genellikle phosphorothioate modifiyeli moleküllerden daha az toksik ve daha spesifiktir. (RNAdegredasyonu)

“Üçüncü generasyon” antisens oligolar (AO).................................. nde birçok modifikasyonlar taşıyabilirler ve ilk iki nesilden daha az toksiktirler. (RNAdegredasyonu)

insanların apolipoprotein B mRNA’sının kodlayan bölgelerine komplementer olan bir phosphorothioate AO’i, ................................... nün azaltılmasında kullanılmıştır. ( RNAdegredasyonu)

Yeni nesil AO’lerin farelerde retrovirüslere karşı korunmanın mümkün olduğu nasıl gösterilmiştir: ( RNA degredasyonu)

............................, insülin benzeri büyüme hormonu I reseptörlerinin lezyonlu bölgede aşırı miktarda bulunması nedeniyle gelişen kontrolsüz epidermal büyüme sonucu oluşur. tedavisinde ......................... kullanılmışıtr.

bir intronda meydana gelen bir mutasyon sonucu bu bölge splicesome tarafından kesim bölgesi olarak tanınabilir ve yanlış bir protein üretilir. Bunun sonucunda normal proteinin seviyesi oldukça azalır. bunun için .............................. AOlar kullanılır.

...............40-50 nükleotid uzunluğunda, farklı katalitik ve substrat bağlanma domainleri olan doğal RNA molekülleridir. ENZİM AKTİVİTESİ GÖSTEREN RNA MOLEKÜLLERİDİR.

ribozimlerin en önemli avantajları:

Ribozimler, hücre içi ribozim üretimine alternatif olarak hedef hücrelere .................. veya ................. ile de verilebilir.

..............................., proteinlere, aminoasitlere, ilaçlara veya diğer moleküllere sıkıca bağlanan RNA veya DNA nükleik asit sekanslarıdır.

Spesifik hedeflere karşı olan aptamerler ..................................denilen bir yöntemle seçilirler.

aptemerlerin avantajları

........................., vascular endothelial growth factor (VEGF)’ yi hedef alır ve bu proteine aşırı yüksek bir afinite ile bağlanır

Genetik hastalıkları tedavi etmek için kullanılan genel yaklaşımlar;

guacher disease

Fabry disease

a-L-induronidaz

SCID (severe combined immunodeficiency disorder)

genlerin aktarılabildiği hücreler

Gen terapisi yaklaşımları:w

Ex vivo gen tedavisi:

.................... de canlının kendi hücreleri canlıya tekrara verirse immün sistem uyarılmaz . dışarıda kültürde tedvi uygulanır ve hastaya verilir.

........................ de başka bir kişiden alınan hücreden uyumlu olanların tedavii sonucu kişiye geri verilmesi immün sistemi uyarır.

ex vivo gen tedavisi dezavantajları:

invivo gen tedavisi

Temel gen ileti m sistemlerinin hepsinin avantaj ve
dezavantajları:

yapay bir insan kromozomu tasarlandı

HAC lar iki yolla üretilebilir:

nonviral gen iletim sistemlerinin iki önemli kısıtlaması bulunmaktadır;

nükleik asitlerin sistemik ve virüs temelli iletimine alternatif olan bazı yaklaşımlar:

siRNA ların dokulara in vivo koşullarda etkili bir şekilde iletilmesi için geliştirilen stratejilerden biri siRNA yı ........... ile eşleştirmektir.

RNA indüklü sessizleştirme kompleksi ile kesim gerçekleştiren yapı ......................... dır.

..........................’ya komplementer siRNA-kolesterol kompleksi bir kere dokuya girdiğinde sens iplik tahrip edilir. ve antisens iplik mRNA ya bağlanır. Buna bağlı olarak da plasmadaki toplam kolesterolde bir azalma olmuştur. kolesterol yerine .......................... ve ...................... gibi birçok molekül siRNA ların hücreye alınmasına aracılık yapar.

............................... bir grup çeşitli biyomolekülleri (peptitler, proteinler, nükleik asitler ve nanopartiküller) taşıyabilen kısa peptidlerdir ve hücreye nüfuz ederek hücre zarlarından geçer

Bakteriler normal olarak çeşitli memeli dokularıyla bir ilişki içinde bulunurlar ve hücreler .....................................üretmek üzere genetik olarak modifiye edilebilirler.

Protein polimeri olan ......................... dana derisinden elde edilir ve asidik koşullarda pepsin ile 300kDa’luk alt birimlerine ayrılır.

kollajen pozitif yüklü bir proteindir ve negatif yüklü mRNA’ larla rahat bir şekilde bağlanabilir. Bu ............................siRNA’ ları nükleazlardan korur ve siRNA’ ların lokal olarak doku hedefli enjeksiyonla iletilmelerini de sağlar.

Herhangi bir hedef proteine karşı ..............................üretilir, bunlar ya da değişken bölgeleri insanlara adapte edilir ve sonra heterolog konukçu hücrelerde üretilmesi sağlanır.

....................i kodlayan gen, pozitif yüklü nükleik asit bağlanan protamin geniyle birleştirilmiştir ve, meme kanseri hücre yüzeyinde bulunan ErbB2 proteinine spesifik olarak bağlanır

şekerler:

APTAMELER:

..................................DNA üzerinde ekleme, çıkarma yapmak ya da DNA dizilimini değiştirmeye olanak tanıyan bir teknolojidir.

CRISPR-Cas9 avantajları

.........................ile kastedilen canlının DNA dizisi üzerinde, Crispr lokusunu tanımlayan gen dizileridir.

......................., bağışıklık sisteminde görev alan proteinlerin genel adıdır.

CRİSPR LOKUSLARINDA BULUNAN ARALIK GENLERİ:

CRISPR, bakterilerde doğal olarak bulunan ve ....................... ile birlikte bakterilerin virüslere karşı savunma sistemini oluşturan gen bölgesidir.

CRISPR-Cas9 sistemi, DNA'da değişiklik oluşturan iki önemli molekülden oluşur:

CRISPR-Cas9 Mekanizması nasıldır?

Fajdan konağa eksojen gen transfekte edildiğinde, bu gen ...................................olarak adlandırılır

Protospacerlerin seçimi, .............................olarak adlandırılan ekzojen genom içindeki hedef dizilere bitişik olarak yerleştirilmiş kısa diziler tarafından belirlenir.

CRISPR lokusu, ............................dizisinden, .................. genlerinden, lider diziden ve ..................... dizisinden oluşur.

Cas9 proteini, .............................. kompleksi ile nükleazları aktive eder. Eksojen gen tekrar istila ettiğinde, Cas9 proteini, spesifik PAM'leri bulmak için eksojen geni tarar.

CRISPR-Cas9 Uygulamaları: